دانلود جزوه | دانلود جزوه
جزوه بیوانفورماتیک با فرمت pdf و ppt
بخشی از متن پاورپوینت:
Alignment
- یکی از اصلی ترین ابزار ها
- اولین مرحله انالیز ساختار و عملکرد توالی
- DNA و Protein محصولات تکامل (انتقال تدریجی)
- حاصل انتخاب طبیعی
- در طی میلیون ها سال (تغییرات تصادفی) انتخاب شده و به ارث می رسند
Alignment و تکامل
- Residue های حیاتی حفظ شده و Residue غیر حیاتی دچار جهش می شوند
- اینترون ها … اگزون ها … دومین ها عملکردی
- انواع تغییرات: حذف ، اضافه ، جایگزینی
- کاربرد :
- بررسی درجه حفظ توالی به کمک Alignment و یافتن فعالیت توالی های ناشناخته و یا یافتن خانواده توالی تعدادی از توالی هایی که به شدت به هم نزدیک هستند
Homology and similarity
- Homology : وقتی دو توالی منشا تکاملی مشترک داشته باشند
- مفهوم کیفی
- مرتبط با فیلو ژنیک
- نتیجه حاصل از Alignment می باشد
- Similarity (تشابه): درصد Residue که با هم Alignment شدند
- مفهوم کمی
- درسطح توالی ها بررسی می شود و نتیجه گیری نمی شود
رابطه همولوژی و تشابه
- چقدر تشابه می تواند همولوگ بودن اثبات کرد؟
- نوع توالی DNA یا Pro
- توالی نوکلئوتیدی (۴ باز) در نتیجه در توالی های غیر مرتبط شانس وجود توالی مشابه ۲0 درصد
- توالی های پروتئینی (20aa) … شانس توالی های غیر مشابه ۵ درصد
- طول توالی
- هر چه توالی کوچک تر شانس Alignment تصادفی بیشتر